Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms