Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms