Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms