Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Brms1Q99N20 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Brms1Q99N20 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Brms1Q99N20 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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