Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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