Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms