Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnajc28Q8VCE1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnajc28Q8VCE1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnajc28Q8VCE1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnajc28Q8VCE1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnajc28Q8VCE1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Dnajc28Q8VCE1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Dnajc28Q8VCE1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Dnajc28Q8VCE1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Dnajc28Q8VCE1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Dnajc28Q8VCE1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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