Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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