Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms