Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms