Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc21aQ8C0S4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms