Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Pdcl3Q8BVF2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Pdcl3Q8BVF2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdcl3Q8BVF2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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