Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ33

Ticrr, Treslin, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TicrrQ8BQ33 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TicrrQ8BQ33 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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