Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8BP99 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8BP99 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Q8BP99 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms