Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdca8Q8BHX3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms