Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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