Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp49Q6P9L4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp49Q6P9L4 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp49Q6P9L4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp49Q6P9L4 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp49Q6P9L4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp49Q6P9L4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp49Q6P9L4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp49Q6P9L4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp49Q6P9L4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp49Q6P9L4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp49Q6P9L4 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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