Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms