Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms