Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms