Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms