Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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