Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms