Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Cbx1-203ENSMUST00000093943 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms