Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm29799-201ENSMUST00000204061 487 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm32916-201ENSMUST00000207884 935 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Fam117bQ3U3E2 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Fam117bQ3U3E2 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Fam117bQ3U3E2 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam117bQ3U3E2 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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