Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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