Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ttc21bQ0HA38 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ttc21bQ0HA38 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ttc21bQ0HA38 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms