Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Thbs3Q05895 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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