Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cxcr5Q04683 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.6 ms