Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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