Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms