Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms