Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms