Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms