Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm38245-201ENSMUST00000191702 2621 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Zfp384-203ENSMUST00000084275 2829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ephb4-205ENSMUST00000166239 3741 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms