Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf1bP97358 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Taf1bP97358 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Taf1bP97358 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf1bP97358 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf1bP97358 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf1bP97358 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf1bP97358 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf1bP97358 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf1bP97358 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf1bP97358 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf1bP97358 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Taf1bP97358 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Taf1bP97358 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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