Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms