Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp25P57080 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp25P57080 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp25P57080 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp25P57080 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp25P57080 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp25P57080 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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