Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp5bP56480 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms