Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms