Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RxraP28700 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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RxraP28700 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RxraP28700 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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