Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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