Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim1P20664 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms