Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms