Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Defa-rs1P17533 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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