Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms