Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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