Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc27a2O35488 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms