Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Edil3O35474 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms