Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms